Исследование Медицинской школы Университета Дьюка Молекулярная клетка представляет наиболее подробный на сегодняшний день анализ вариантов SARS-CoV-2 от Omicron XBB, которые появились в конце 2022 года и эволюционировали, чтобы оставаться заразными, уклоняясь при этом от иммунной системы.
По мере того как вирус Омикрон и его варианты распространились в местных и глобальных сообществах, они усовершенствовали свои белки-шипы, чтобы они плотно прикреплялись к клеткам и заражали их, одновременно затрудняя распознавание вируса иммунной системой. Белки-шипы XBB также эволюционировали и стали более стабильными.
Исследование, проведенное учеными из Кафедра биохимии И Институт Дьюка человеческих вакцин может повлиять на продолжающуюся борьбу с COVID-19. Текущая бустерная вакцина против COVID-19 включает модифицированную версию шиповидного белка XBB 1.5. Анализируя структуру и функцию белков-шипов, герцог Команда получила знания об эволюции вируса и факторах, определяющих его адаптивность.
Исследователи использовали криоэлектронную микроскопию, чтобы расшифровать структуры этих белков-спайков, что позволило визуализировать их форму и функцию на атомном уровне. Этот метод, заключающийся в замораживании белков в растворе и получении сотен тысяч изображений с помощью электронного микроскопа, позволил исследователям реконструировать трехмерные структуры белков Spike линии XBB.
«Даже небольшие изменения в структуре белка могут оказать существенное влияние на поведение вируса», — сказала Элли Чжан, ведущий автор исследования и аспирант кафедры биохимии.
В исследовании также использовались поверхностный плазмонный резонанс и иммуноферментный анализ (ELISA) для измерения способности белков связывать антитела, а также дифференциальная сканирующая флуориметрия (DSF) для оценки их стабильности.
«Детали на атомном уровне, выявленные в этом исследовании, не только расширяют наше понимание того, как вирус продолжает развиваться, но также предоставляют важные данные, которые могут помочь в разработке вакцин следующего поколения», — сказал автор исследования. Приямвада АчарьяДоктор философии, доцент кафедры биохимии и член Института человеческих вакцин Дьюка.